Manisa Celal Bayar Üniversitesi Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, 04.08.2023 tarih ve 32269 sayılı Resmi Gazete’de yayımlanarak yürürlüğe giren Cumhurbaşkanlığı Kararı ile üniversitemizin Fen Bilimleri Enstitüsü, Sosyal Bilimler Enstitüsü ve Sağlık Bilimleri Enstitülerinin kapatılması ve bu enstitülerde yer alan tüm anabilim dallarının lisansüstü programları ile bu programlara kayıtlı öğrencilerin Lisansüstü Eğitim Enstitüsü’ne aktarılması ile kurulmuştur. Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Manisa Celal Bayar Üniversitesi’nin yüksek lisans ve doktora düzeyinde eğitim veren temel birimidir. Enstitümüz bünyesinde Eylül 2024 itibariyle 63 Anabilim Dalı mevcuttur.